《暗格里的秘密》根据耳东兔子的同名小说改编，从互相排斥的同桌，到彼此陪伴的挚友，他们在青春的道路上共同经历了低谷与迷茫。但正是这些经历，让他们更加珍惜彼此，最终成就了更好的自己！
第1集 丁羡新大学寻周斯越 回忆初遇周斯越
在大学校园里的开学第一天，丁羡推着行李箱去了男生寝室去找周斯越，没想到被宿管阿姨给拦下不让进去，丁羡没有顾及校园里众人的眼光，站在楼下大喊周斯越的名字，叫他去接自己，很多人都在关注着丁羡的举动，而周斯越也知道了丁羡在找他赶紧关掉年脑从教室跑回宿舍楼见丁羡。周斯越阳光帅气的面庞是很多学生的偶像，有人那样叫喊他自然会受到大家的关注。丁羡很直接的告诉周斯越喜欢他，而周斯越却不想恋爱，叫丁羡回去上课，他们都有各自的生活。不过丁羡没有退缩，拿出了一个机器人送给了周斯越，那里有丁羡的秘密。
第2集 丁羡初入新班级
班上其他同学听到丁羡的话哄堂大笑，刘晓峰说周斯越的数学一直都是年级第一，就连去年参加机器人大赛耽误了时间，那也是随随便便就考进了深海中学。班长婉婉故意让同学们不要嘲笑丁羡，然后以请周斯越讲题为由，让丁羡让出位置。丁羡一个人跑到阳台上黯然伤神，柏从见状将她带到了天台上。丁羡告诉柏从，她觉得和班上的同学格格不入，自己好像怎么努力都赶不上他们。柏从说丁羡现在的处境他完全明白，和他当年刚到深海中学是一模一样的。确实他们和同学之间的差距是客观存在的，自己当初刚来的时候，觉得整个人世界观都颠覆了。
周斯越将糕点交给丁羡，丁羡直接还给了他，婉婉见状接过了糕点。课间休息回来，丁羡发现自己没有数学试卷，问了一圈谁也没有给她留，她只有去找刘老师。丁羡看到丁文成的桌子上有一本精致的笔记本，上面还有他写给自己的信。
刘老师要出去开会让大家自习，让婉婉将说话的同学都记下来，等他回来惩罚。丁羡向刘晓峰借笔记，不想被何星文举报，丁羡和刘晓峰都被记了下来。刘老师对于两人恨铁不成钢，丁羡在上面委屈的都快哭了，周斯越见状举报了其他同学，同学又把何星文等人举报了。被举报的人留下来做值日，何星文说自己自从遇到丁羡就没有好事，同学忍不住的为丁羡说话。
第3集 周斯越辅导丁羡
丁羡将丁文成带的巧克力分享给大家，婉婉见状嫌弃的说学校不准吃零食，再说了周斯越也不能吃这样的啊，自己吃的可都是进口的。丁羡顿时尴尬不已，周斯越一把撕开巧克力放入嘴中，说自己正好低血糖。刘晓峰说最近周斯越对丁羡的关注有点多，周斯越说大家都是同学，两家又是认识的关系，关心一下有什么大惊小怪的。虽然周斯越说的云淡风轻，但刘晓峰还是捕捉到一丝不寻常的宠溺。
第4集 丁羡周斯越互换跨年礼物
丁羡带着柏从的英语笔记回到教室，不想周斯越已经帮她把英语笔记抄好了。周斯越看着笔记本上柏从的名字，眼神黯淡了下来。晚上回家后，丁文成问丁羡最近和周斯越重新做同桌的事情，说自己特意拜托了周斯越照顾她。丁羡一听就生气了，说她不需要丁文成为自己做这些。第二天上学的时候，丁羡没有等周斯越先走了，朋友们都以为他们吵架了，丁羡说她和周斯越也不是很熟。
第5集 “新同桌”周斯越
丁羡在家里养病，周斯越上门拜访，说自己给她送作业来了。丁母将周斯越请进丁羡的房间，丁羡赶紧将自己的衣服玩偶藏好。周斯越一进来就看到丁羡小时候的照片，丁羡难为情的赶紧挡在前面。周斯越将作业和笔记拿给丁羡，丁羡嘴硬的说这些都可以交给妈妈就可以，问他为什么要进自己的房间。周斯越拿出成绩条，作势要拿给丁母看，丁羡赶紧抢过来。周斯越说丁羡抱病参考还能有这个成绩就不错了，问她想不想知道自己考了多少，丁羡直接拒绝了。丁羡说他们要回老家过年，周斯越将自己的电话号码写下来给她，让她有不懂的问题就打电话给自己。
第6集 周斯越误会丁羡送礼
周斯越仔细比对了信和丁羡冬给自己的贺卡，确定上面的笔记是一模一样的，这让他高兴不已。次日，心情大好的周斯越主动给丁羡买了礼物，说自己看了她的信，这次就原谅她了。孔沙迪看不过去了，说那封信是尤可可写给周斯越的，周斯越的脸色顿时拉下来。丁羡委屈的解释自己也不知道该怎么拒绝，孔沙迪把信撕了自己不知道该怎么办，只好重新誊抄了一遍。
新学期即将开始了，周斯越和朋友一起打篮球，暑假的时候他参加了机器人大赛拿了奖，可是他并不开心。今天就在周斯越的生日，他看着在不远处画画的丁羡，忍不住的叹气。弟弟在不远处被人欺负，丁羡前去营救，宋子琪说现在就是最好的机会了。晚上，朋友们聚在一起为周斯越庆祝生日，可宋子琪坚持要等等。
第7集 丁羡因周斯越选理科
丁羡给妈妈说了自己想要学理科的事情，妈妈一听就生气了，说丁羡的优势是文科，让她一定要选择文科，丁羡见状赶紧躲回房间去。丁文成给丁羡买了一部手机，丁羡见状愧疚不已，说周斯越已经借给她一部了。丁文成其实早就知道了这件事情，他让丁羡把手机还给周斯越，并且规定新手机不能带到学校去。丁羡苦恼的说妈妈不准让自己学理科，丁文成客观的说女孩子学习理科确实会很累，建议丁羡好好考虑妈妈的建议，不管她做任何决定，自己都会尊重她的选择。
第8集 周斯越私自离校送丁羡回家
丁文成明白丁羡对妈妈自作主张的抵触情绪，但是他希望丁羡要理解妈妈的一片苦心，责备她瞒着家人自己做了这么大的决定。丁羡请爸爸帮忙向妈妈求情，她不想离开现在的同学们。丁文成给丁羡出了一个主意，让她和妈妈约定，要是这次测试能够考出妈妈满意的成绩，说不定妈妈就能同意了。刘老师也在班上给大家建议，如果觉得自己学习理科跟不上，随时都可以转到文科班去。
第9集 周斯越安慰丁羡
丁羡正在给周斯越煲电话粥，妈妈发现后把手机收走了，说先替她保管着，让她先好好学习。宋子琪和朋友们聚在一起为孔沙迪庆祝生日，不想几个男生闯进保健要强行拉走孔沙迪。宋子琪挡在他们的面前，说自己认识将臣，几人当场灰溜溜的走了。女同学看到宋子琪轻易的摆平了几个人都崇拜不已，宋子琪沾沾自喜，让孔沙迪以后跟着而自己，他绝不会让她受委屈。
刘老师在班上宣布，周斯越已经通过了测试，可以代表学校去参加奥数比赛了。何兴文对于刘老师的决定嗤之以鼻，觉得刘老师偏袒周斯越，之前偷偷出去刘老师都没有追究。同学们听了何兴文的话，都觉得是他嫉妒周斯越。丁羡忍不住的为周斯越抱屈，让何兴文觉得不公平就去找老师，不要在背后嚼舌根。丁羡去周家玩，周母不在家，她给周斯越煮了泡面，还主动喂给他吃，两人之间的气氛越来越暧昧。
第10集 周斯越送丁羡绘画工具
丁羡和孔沙迪看到周斯越和一个女生在篮球馆说话，于是让宋子琪去打探他们聊天的内容。宋子琪研究了两人的唇语，说他们在谈论话剧方面的内容，丁羡以为周斯越是要和这个女生去看话剧。丁母去周家做客，毫不掩饰对周斯越的欣赏和喜爱，说他成绩好，丁羡成绩就是上不去。周斯越让她要对丁羡有信心，丁羡一定会拿出好成绩向大家证明的。
第11集 两人感情更进一步
丁羡获得了绘画比赛的第一名，大家聚在一起为他们庆祝。宋子琪问丁羡有什么理想，丁羡赶紧岔开了话题。回去的路上，周斯越给丁羡说起了蒋沉的事情，丁羡说自己很羡慕他们都有各自的理想，可是自己好像什么理想也没有，就连绘画也只是一个业余爱好。周斯越说所有的理想都是因为兴趣爱好发展起来的，丁羡不过是还没有认识到而已。晚上，丁羡在网上搜索自己的梦想，可是又觉得自己和梦想之间的距离太过遥远。
第12集 周斯越家庭发生争吵
丁羡的奶奶突发重病住进了重症监护室，丁文成和丁母带着弟弟回去照顾奶奶，将丁羡拜托给了周母。晚上在周家吃过饭后，丁羡回到自己家，她发现门外有人影闪过，想起周斯越给她说过的危险，只得壮着胆子捏着扫帚躲在门外。家门被人从外面打开了，丁羡大叫着冲上去对着进来的人拳打脚踢，结果却发现是周斯越。周斯越说刚才保安在楼下抓到了一个来踩点的小偷，丁羡的家门口已经被他标了记号。
第13集 周斯越保送华清大学
丁羡因为周斯越的信任和鼓励暗自高兴，就连做梦都梦到她也考到了江陵市，和周斯越并将站在一起。孔沙迪看着她傻乐问她是否有情况，丁羡打死都不肯承认。这天放学回家后，周斯越说自己过些日子就要去比赛了，要丁羡好好的把心思用在学习上，珍惜现在自己随时都可以给她不可的日子。深海市突然下起了暴雨，丁羡听着轰隆隆的雷声，看着不断闪烁的闪电吓得不行，周斯越将自己的耳机给丁羡戴上。丁羡心中就像吃了蜜糖一样，鼓起勇气告诉周斯越，自己的愿望就是考取江陵市的大学。
第14集 丁羡复读考华清
很快高考就结束了了，丁羡却发现自己的很多题目都忘记了怎么做。丁羡陷入了自怨自艾的情绪中，觉得自己和周斯越的差距越来越大了，以后肯定不能在一起。孔沙迪也和丁羡有着一样的苦恼，她和宋子琪也要分开了。丁羡和孔沙迪借酒浇愁，发誓要做永远的好朋友。丁羡喝醉了，将垃圾桶当成了周斯越，抱着不肯撒手。宋子琪和周斯越得知两人出门买醉便去找她们，丁羡最后吐真言，说自己不想和周斯越分开。的身后。
第15集 回忆结束 周斯越因为家庭不敢靠近丁羡
周斯越在学校受到了教授和同学的青睐和追捧，叶教授叮嘱他做好实验室的事情，并且询问了关于周父涉嫌抄袭的事情。董正飞对周斯越嫉妒不已，决定对他进行报复。有个叫做邢露菲的女生公开要追求周斯越，被拒绝后依然不离不弃。周斯越发现有人在网站上曝光了周父涉嫌抄袭的事情，还说周斯越是凭借周父的关系才进入华清的。周斯越很快就通过网络IP追踪到了消息的发布者，正是董正飞。
第16集 丁羡靠近周斯越
周斯越把工资交给了妈妈，自从爸爸出事后，整个家庭的开销都压在周斯越的肩上，这让妈妈觉得愧对他。丁羡偷偷的跟踪周斯越，这才知道他家里的情况。丁羡找到周斯越，希望他不要因为家庭的变故就放弃他们之前的所有，但周斯越说自己从未爱过丁羡，他对她只有朋友之谊。丁羡打电话向孔沙迪诉苦，孔沙迪也因为宋子琪不告而别伤心，她希望丁羡能帮她把宋子琪找回来。宋子琪拖着行李去投奔周斯越，他因为打架被学校记过，还和孔沙迪分手了。
第17集 周斯越牵线 丁羡认识叶教授
丁羡的漫画得到了主编的认可，劝说丁羡去参加绘画比赛，丁羡有些犹豫。丁羡去周斯越打工的餐厅吃饭，希望能够多些时间和他在一起。周斯越将一份有关实验的卷子交给丁羡，让她好好做。丁羡心中甜蜜不已，她就知道周斯越虽然表现的很冷漠，但依然喜欢自己。
丁羡考上了科研小组，叶教授觉得她很有慧根，于是让周斯越好好的带带她。周斯越让丁羡不要放松，要是她的课题通不过出国也就泡汤了。丁羡说只要是周斯越喜欢的她都会喜欢，只要能和他在一起自己愿意努力。叶教授让董正飞给新生介绍科研小组的情况，董正飞提醒她们一定要有对科研实验有兴趣和热情，否则就相当于自毁前途。丁羡根本就听不进去，她一心追逐着周斯越，把他当成自己最大的爱好。
第18集 柏从周斯越针锋相对
丁羡决定去参加绘画比赛，不过报名时间早就过了，于是她找到了之前就对她很欣赏的孙编辑，希望她能够帮自己通融一下。孙编辑让丁羡回去等消息，说自己需要和组委会商议一下。动向和孔沙迪见了面，两个为情所困的人互相倾诉，她们都不明白，为何当初的美好会变得形同陌路。孙编辑通知丁羡可以和公司签约了，丁羡高兴不已。
第19集 周斯越丁羡约会游乐场
丁羡和孔沙迪一路跟踪周斯越来到他的出租房外，孔沙迪明确的表示宋子琪就在这里，宋子琪只好开门将她们迎进来。孔沙迪一见面就把宋子琪一通教训，说他只知道逃避。丁羡和周斯越见状只得出去，将空间留给两人。丁羡孔沙迪说当初是宋子琪非要给自己在一起，也是他坚持要异地恋，但是现在就因为退学就开始一蹶不振，装颓废装懦夫，这样能够解决问题吗。宋子琪说自己也不想，让孔沙迪回去算了。
第20集 柏从和周斯越成为情敌
动漫展就要开始了，邢露菲让丁羡去装车，趁机将丁羡的手机放在车上，还将她关进厕所，觉得这样就能阻止她去周斯越的机器人比赛了。周斯越一直在等待着丁羡的出现，否则他的比赛就没有意义了。周斯越在比赛中展示了一个产品，剩下的他要等到丁羡来了才展示。周斯越去动漫展找丁羡，这才将她从厕所中解救出来。周斯越告诉丁羡，自己本来想要在机器人大赛上向丁羡表白的，因为第一名也没有丁羡重要。保安误将周斯越当成流氓抓到了保安室，最后还是柏从出面才将他们带回来。
第21集 丁羡表白周斯越
丁羡被柏从说服再次回去与投资人谈判，投资人以为丁羡回心转意了，便将自己的想法完完整整的讲给丁羡听。丁羡觉得投资人和自己的创造意图越来越远，于是直接拒绝了投资人的意见，投资人生气不已，说丁羡不识抬举，他们公司签约的可都是人气流量都是一流的作者。这时候，周斯越赶了过来，说丁羡的作品不适合投资人追求的商业，然后就带着丁羡离开了。
第22集 周斯越丁羡初吻
周斯越回去自己家的房子里住，丁羡陪着他一起回去打扫卫生。就在两人抱着彼此你侬我侬的时候，丁母却抱着被子出现了，吓的两人赶紧松开。丁母回来后怎么想着两人的状态都不对劲，于是找弟弟过来逼供。弟弟没有办法只好坦白了实情，丁羡和周斯越就是恋爱关系，周斯越就是丁羡的小甜心，这让丁母非常吃惊。丁文成得知丁羡和周斯越谈恋爱之后，表示自己同意他们交往，但是必须要得到妈妈的同意，所以他们要提前做好准备。
第23集 周斯越丁羡见家长
丁羡得知周斯越与洪荒公司合作责备他没有和自己商量，对于周斯越来说洪荒并不是好的选择。周斯越却说，只要能够对她有利自己怎么样都无所谓。晚上，丁羡和周斯越躺在穿上，两人相拥而眠。丁羡接到了电话，说周斯越将洪荒科技的技术泄密被警方逮捕。这件事情就被传的沸沸扬扬，周父得知后病情突然加重。丁文成和丁母也打电话问丁羡情况，他们都相信周斯越。
第24集 周斯越求婚丁羡
周斯越放弃了出国的名额，丁羡知道后非常不高兴，她不愿意让周斯越因为自己放弃了学业，希望周斯越能够有更好的未来。周斯越告诉丁羡，自己确实舍不得离开丁羡。丁羡说只有他们全力以赴成为更好的自己。宋子琪和蒋成去给周斯越送行，宋子琪喝的醉醺醺的，他和周斯越从小一起长大感情深厚，现在他们就要分隔大洋两岸，他真的舍不得周斯越。
