《看不见影子的少年》大结局并没有太出乎意料的地方，其实第十集左右就已经能把剧情推测个七七八八了，后面除了豆豆事件基本也没什么悬念了，只是把前面一些不影响结局走向的疑惑给解了。
1.边杰之死。
金燕推攘边杰致使其头撞在钉子上休克倒地（并未真正死去），随后金满福为了帮女儿掩盖杀人罪行，当晚冒雨将其带出准备埋葬，但过程中边杰醒来，金满福在边杰逃跑途中看到杜一拍摄的金燕洗澡的照片，却误以为是边杰拍摄，随后起了杀心，将边杰活埋于其外婆墓下。
2.豆豆丢失原因。
金满福和边美珍再婚后一直想和她再有一个儿子，但边美珍不愿意。金满福觉得是因为有边杰在，导致边美珍为了保护自己的儿子不愿意再要。因此联系人贩子，准备将边杰带走。但当天边杰和豆豆换了衣服，导致人贩子认错小孩，带走了豆豆。
3.王士涂以身入局解密案件真相。
金满福以找回豆豆为由，企图和王士涂交易救出金燕。王士涂在向组织报告后并获同意后，将计就计，向金满福透露只要找不到边杰尸体，金燕就会平安无事。金满福听后，为了彻底销毁物证，深夜前往外婆墓地挖掘边杰尸骸，后来被警察成功在现场抓获。
4.边杰是豆豆吗？
剧情并未交代，且未交代豆豆去向，王士涂最后还是没有找到豆豆，升职去了另一个县刑警支队做队长。
